1988年7月12日 香港天主教聖經學院正式成立。
1988年9月 第一屆文憑課程開課。
1990年9月 開辦聖經普及課程。
1991年 成為耶路撒冷方濟聖經學院屬校
1991年 文憑課程第一屆學生畢業。
1992年 學院辦事處由堅道教區中心十樓遷至窩打老道130號教研中心。
1992年 選出學生代表列席幹事會，以加強學院與畢業生和在學同學的溝通。
1994年 公開聖經講座：新盟約、新生命（耶30-31） 主講：Rev. G. Fischer (Innsbruck大學神學院講師）。
1994年9月

耶路撒冷方濟聖經學院院長聶家祺神父（Fr. A. Niccacci）造訪，並主持兩個公開聖經講座：
．考古學與新約
．智慧文學
1996年7月 學院辦事處遷往九龍窩打老道133號方濟會會院。
1997年6月 聖經學院成為世界聖經協會會員
1997年12月 獲方濟會意大利沙里諾會省頒授獎學金，每年三個名額，予文憑課程成績最優異的同學。
1998年9月

十週年紀念公開聖經講座:
．「聖神與中國教會」（陳日君助理主教）
．「福音是否神話」（黃懷秋女士）
．「聖經_基督徒的經典」（高夏芳修女）

2000年8月 方濟會會院須拆卸重建，學院辦事處遷往九龍油麻地永星里2號16樓。
2001年4月 公開聖經講座：「一神宗教中的天主聖三」（房志榮神父）